Der bald 24-jährige Malgin unterschrieb am 2. Oktober einen Ein-Jahres-Vertrag mit den Maple Leafs, zu denen er zur NHL Trade Deadline am 25. Februar von den Florida Panthers gewechselt war. In 36 Spielen für die Panthers in 2019/20 verbuchte Malgin vier Tore und acht Assists zu zwölf Punkten. Nach seinem Wechsel zu Toronto blieb er in acht Partien ohne Punkt.
Für Lausanne markierte Malgin in 19 Spielen dieser Saison starke 22 Punkte (elf Tore, elf Assists) und steht damit auf dem vierten Platz der Scorerwertung.