"Teď jsem na to vůbec nemyslel," prohlásil Thornton v květnu 2022 poté, co byli Panthers vypadli ve druhém kole Východní konference s Tampa Bay Lightning. "Myslím, že je to ještě moc rychlé. Nečekal jsem to. Překvapilo mě to, takže si určitě promluvím s rodinou a uvidím, jaký je náš další plán. Ještě jsem se nerozhodl, jestli hrát nebo ne, ale promluvíme si a uvidíme, jak to budeme všichni cítit."
V roce 1997 si jej Boston Bruins vybrali jako jedničkou draftu. V historickém pořadí NHL je dvanáctý s 1539 body za 430 gólů a 1109 přihrávek, sedmým v počtu asistencí a šestým s 1714 odehranými zápasy. Hrál za Panthers, Toronto Maple Leafs, Sharks a Bruins. V play off nastoupil k 187 utkáním a nasbíral 134 bodů za 32 tref a 102 asistencí.
V letech 2005 až 2020 strávil 15 sezon v San Jose. Drží klubový rekord Sharks v počtu asistencí (804), je druhý v produktivitě (1055), třetí v počtu utkání (1104) a čtvrtým nejlepším střelcem (251). San Jose se během 15 let jeho působení dostalo třináctkrát do play off. V roce 2016 se dostalo až do finále Stanley Cupu, v kterém prohrálo s Pittsburgh Penguins v šesti zápasech.
Thornton získal Hart Trophy pro nejužitečnějšího hráč v NHL i Art Ross Trophy jako nejproduktivnějšího hráče v sezoně 200506, když v 81 zápasech za Bruins a Sharks nasbíral 125 bodů za 29 branek a 96 asistencí. "Je to pro mě velká čest, že jsem měl možnost hrát tak dlouhou dobu. Nic neberu jako samozřejmost," řekl Thornton v květnu 2022. "Nikdy nepřemýšlím o tom, co by kdyby, abych k vám byl upřímný. Snažím se žít okamžikem a jít dál."