Hischier bestritt zuletzt seine erste komplette Saison in Nordamerika für Halifax in der Quebec Major Junior Hockey League. Er und Nolan Patrick aus Brandon galten im Vorfeld als die aussichtsreichsten Kandidaten für die allererste Wahl beim NHL Draft 2017. Die Devils kamen zum Zug, nachdem sie am 29. April die Draft-Lotterie gewonnen hatten.
Hischier ist bereits der fünfte Spieler aus Halifax, der in den vergangenen fünf Jahren bei einem NHL Draft unter den Top 10 landete. Vor Hischier waren dies Nathan MacKinnon (Nr. 1, Avalanche) und Jonathan Drouin (Nr. 3, Tampa Bay Lightning) 2013, Nikolaj Ehlers (Nr. 9, Winnipeg Jets) 2014 sowie Timo Meier (Nr. 9, San Jose Sharks) 2015.
Hischier beendete die Saison 2016/17 mit 86 Scorer-Punkten (38 Tore, 48 Vorlagen), elf Powerplay-Toren und drei Treffern in Unterzahl. Insgesamt bestritt er 57 Begegnungen für Halifax in der Hauptrunde. Er wurde mit der Michael Bossy Trophy für den besten professionellen Nachwuchsspieler und der Michael Bergeron Trophy als offensiver Rookie des Jahres ausgezeichnet.
Für die Schweiz kam er 2017 zu mehreren internationalen Einsätzen, unter anderem bei der IIHF Junioren-Weltmeisterschaft. Bei diesem Turnier verbuchte er sieben Scorer-Punkte