Karlsson a subi une intervention afin de soigner une blessure à l'aine le 31 mai. Les Sharks ont indiqué qu'il devrait être en santé à temps pour le début de la prochaine saison. Il a été acquis le 13 septembre en compagnie de l'espoir à l'attaque Francis Perron dans une transaction avec les Sénateurs d'Ottawa en retour des attaquants Chris Tierney, Rudolfs Balcers et Josh Norris, du défenseur Dylan DeMelo et d'un choix de deuxième ronde au Repêchage 2019 de la LNH, ainsi qu'un choix conditionnel au Repêchage 2020.
« Nous sommes extrêmement heureux qu'Erik et son épouse Melinda se soient engagés de la sorte avec les Sharks de San Jose, et qu'ils aient choisi de le faire avant le 1er juillet, a mentionné le directeur général des Sharks Doug Wilson. Des joueurs comme Erik dont le talent appartient à l'élite sont rares et lorsqu'ils deviennent disponibles, il est important d'être agressif pour les obtenir. Il est un joueur qui est capable de faire la différence et qui rend constamment les joueurs autour de lui meilleurs. Nous sommes très contents qu'il ait été proactif dans le traitement de sa blessure subie la saison dernière, et nous avons hâte de le voir évoluer au sein de notre organisation pendant plusieurs années.
« Je veux aussi remercier Hasso Plattner et notre groupe de propriétaires pour le dévouement constant et leur soutien financier afin que nous puissions assembler une équipe talentueuse dont les partisans des Sharks peuvent être extrêmement fiers. Grâce à leur soutien, nous avons été en mesure de créer et maintenir une culture gagnante à San Jose, faisant ainsi de cette ville un endroit où les joueurs veulent jouer. »